Biskup Šuštar rođen je 27. travnja 1959. u Ljubljani. Nakon osnovne škole od 1974.-1978. bio je u Malom sjemeništu u Vipavi, a po maturi i odsluženju vojnoga roka ušao je u bogosloviju i upisao Teološki fakultet u Ljubljani.

Nakon druge godine studija, tadašnji nadbiskup Alojz Šuštar šalje ga u Rim, gdje je bio pitomac Papinskog zavoda Germanicum, a studij je nastavio na Gregoriani, gdje je i doktorirao. Za svećenika je zaređen u Ljubljani 29. lipnja 1985.

Od 1991. do 1997. bio je ravnatelj Bogoslovnog sjemeništa u Ljubljani. Potom je postao župnik u Grosuplju, a nakon toga je bio imenovan katedralnim župnikom u Ljubljani i arhiđakonom. Godine 2007. ponovno je imenovan ravnateljem bogoslovije.

Ređenje novoga biskupa bit će u nedjelju, 15. ožujka u 15 sati u ljubljanskoj katedrali Sv. Nikole.
Nakon objave imenovanja, novoimenovani biskup je rekao: Biskupska služba obuhvaća široko područje u Crkvi. Na to gledam s velikim poštovanjem, pa čak i strahom, povjeravam se i molim da budem vrijedno oruđe u Božjim rukama.

U dosadašnjem svećeničkom životu sam to često iskusio. Koliko puta sam se divio Gospodinovoj blizini i njegovu konkretnu djelovanju… Vjerujem i želim da po Crkvi, koja je svjetlost narodima, i dalje dijeli svoje nebeske darove mira, ljubavi i puninu života. Želim da ih ne dijeli samo vjernicima okupljenima u Crkvi, već svim ljudima.

U tom duhu sam izabrao i biskupsko geslo „Gospodin je blizu" (Fil 4,5). Gospodinova blizina, njegovo djelo spasenja je zapravo razlog za radost, za nadu, za prevladavanje problema i izgradnju međusobne ljubavi. Ove riječi su dio mog mladomisničkog gesla koje je glasilo „Radujte se u Gospodinu uvijek! Gospodin je blizu!" Raduje me, da je nadbiskup Stanislav Zore za svoje geslo izabrao prvi dio svetopisamskog teksta. Neka i ovo geslo potvrđuje jedinstvu u Gospodinu, rekao je novoimenovani ljubljanski pomoćni biskup Franc Šuštar.